Более трех столетий назад закончилась Великая Война, которая принесла гибель многим невинным людям, и в настоящее время поделила общество на две половины. Те, кто проживает в Небесном городе и относится в верхушке социальной элиты и те, кто вынужден проживать на свалках и довольствоваться тем, что на них находит.
Вот и в нашем случае речь пойдет о находке доктора Идо, который обнаружил на свалке сломанного киборга под именем Алита. После ремонтов Алита ничего не помнит из своего прошлого, но обнаруживает в себе боевые навыки и теперь ей необходимо восстановить потерянные фрагменты памяти и найти виновников по чьей причине она оказалась на свалке.